En mettant à disposition des chercheurs du projet Folding@Home la puissance inutilisée de votre machine, vous pouvez aider la recherche en biologie moléculaire dont les travaux. PC Astuces s'associe à ce grand projet.

Introduction

Depuis plusieurs années les chercheurs en biologie moléculaire ont démontré, par l'observation et l'expérimentation, que l'action d'une protéine est liée à sa forme en 3 dimensions. L'état actuel des connaissances nous apprend que de nombreuses maladies, génétiques ou non, se traduisent par des anomalies dans la forme des protéines. L'exemple le plus célèbre étant le prion (responsable de la tremblante du mouton, des maladies de la vache folle et de Creutzfeld-Jakob). D'autres exemples de maladies impliquant une mauvaise conformation des protéines sont la maladie d'Alzheimer et de nombreux cancers.

Il est donc important, connaissant la formule chimique d'une protéine, de connaître également les différentes formes qu'elle peut prendre en se repliant, ceci pouvant déterminer son caractère "normal" ou "anormal", inoffensif ou pathogène. Ce repliement étant trop rapide pour être observé "in vivo", une équipe de recherche de l'Université de Stanford, animée par le professeur Vijay Pande, le Pande Group, a décidé d'avoir recours à la simulation informatique pour remédier à cette impossibilité. Il s'agit du projet Folding@home.

Cette simulation nécessite une énorme puissance de calcul qui représente un investissement financier hors de portée de la plupart des services de recherche universitaires. En se fondant sur le modèle adopté par l'Université de Berkeley pour le projet Seti@Home, Le Pande Group fait appel à la technique du calcul distribué qui consiste à "découper" en petites unités indépendantes les calculs à effectuer pour les répartir entre de très nombreux ordinateurs du type ordinateur personnel/ Pour obtenir la puissance de calcul nécessaire à un avancement rapide des recherches, le Pande Group fait appel, dans le monde entier, aux possesseurs d'ordinateurs personnels, disposant d'une connexion à l'Internet, pour offrir au projet la puissance inutilisée de leurs machines.

Après avoir installé et configuré un logiciel client sur votre machine, celui-ci va appeler un serveur de Folding@home, charger une unité de travail (WU), effectuer les calculs, renvoyer les résultats au serveur, charger une nouvelle unité, et ainsi de suite, aussi longtemps que vous souhaiterez contribuer à ce projet scientifique. Folding@home est programmé pour adopter le niveau de plus basse priorité, ce qui signifie que dès que vous avez besoin de puissance pour une tâche, celle-ci est automatiquement libérée, de manière parfaitement transparente. Votre ordinateur n'est jamais ralenti. Pour plus d'information sur l'impact de Folding@home sur les performances système, n'hésitez pas à consulter cet article.

Comment participer ?

Pour participer vous aussi à ce grand projet auquel PC Astuces s'associe, c'est très simple. Il vous suffit pour cela de :

• Télécharger le client ici et de choisir votre OS (Windows, Linux ou MacOS) ainsi que la version console. Celle-ci est conseillée par rapport à la version graphique car elle est plus rapide et plus stable.
• En UserName mettre le préfixe [PCA]_ suivie de votre nom, [PCA]_Clement par exemple pour moi. Vous ferez ainsi parti de la mini équipe PC Astuces.
• En Team Number mettre le numéro 51 Vous rejoindrez ainsi avec nous l'Alliance Francophone, la premiere équipe francophone participant au projet.
• Répondre "n" aux autres questions. (plus de détails ici)

Les stats

• Stats de la mini-team PC Astuces
• Stats totales de l'Alliance francophone

Je tiens à remercier vivement Wis, initiateur de ce sujet pour le forum PC Astuces. J'espère que vous serez nombreux à nous rejoindre dans la mini-team PC Astuces A bientôt,

Salut a tous :) n'hesitez pas si vous avez une question :) et tout comme clement , j'espere que vous serez nombreux a faire partie de ce projet :)

Bonjour aux Astucieuses et Astucieux PCistes [hello] Et merci de votre participation au projet folding@home dans l'Alliance Francophone [chinois] JY.

Pour une fois, mon PC sert à quelque chose d'utile !

J'aimerais savoir si une connexion basse vitesse avec modem peut-être utile? Merci

Bonsoir, Une connexion bas débit ne pose aucun problème pour participer à Folding. Il est vrai que le téléchargement des paquets à traiter sera alors plus long (2 minutes sous un 56K), mais déjà, avec un paquet, tu as de quoi faire [smile] Plus d'infos ici : http://www.alliancefrancophone.org/faq.php3?action=view&faq_id=7&config= A bientôt, Clément

Bonne nuit Clement ! Voilà je fais partie du team PCA mais j'ai un petit souci : je n'ai du répondre "n" à aucune question !!! J'ai vérifié et le programme est bien installé !

moi qui veut devenir bio-informaticien, j'ai trouvé un bon moyen d'aider mes futurs collègues, on risque de devoir souvent utiliser cette méthode en France si le budget de la recherche continu a etre aussi bas

Chez moi aussi !

Lors du téléthon 2003 je me suis inscrit pour le décrypton. Est ce que c'est lié au projet Folding@home ?

Le seul point commun, c'est que le projet aide la recherche medicale ... sinon decrypton etait sur le genome, et ici, c'est des proteine :)

Bonjour, Les réponses "n" concernent en particulier les personnes qui ont décidé d'utiliser le client texte (aussi appelé "console"). Si vous avez choisi le client graphique, alors la configuration se fait directement par l'intermédiaire de boites de dialogues et vous n'avez pas de "n" a mettre nulle part [smile] Si vous voulez etre sur que votre client est bien configuré (compte et numero d'équipe), vous pouvez visualiser le fichier client.cfg localisé dans le répertoire d'installation du programme folding@home. Malgré son extension (.cfg) c'est un fichier texte classique donc vous devriez pouvoir l'ouvrir avec votre éditeur préféré (par ex. le bloc-note, sous windows) Dedans, vous devriez trouver au moins les 2 lignes suivantes [code] username= team= [/code] a droite de "username=", vous devriez trouver votre nom de compte (par ex. [PCA]_Clement, pour clement) et à droite de "team=" , vous devriez avoir 51 (c-a-d le numéro de l'Alliance Francophone) Si ce n'est pas le cas, il vous faudra refaire la configuration. Si vous avez des questions ou n'étes pas sur de votre configuration, n'hésitez pas à poster un message ici ou sur le forum de l'Alliance Francophone pour que l'on puisse vous aider ... A bientot, JY.

Bonsoir à tous, je l'ai installé et cela marche d'enfer : pour une fois que je sers à quelque chose [smile] C'est bien la premièer fois que mon CPU est à 100 % pdt si longtemps ... J'en regrette même de ne pas avoir investi dans une station Bi-proc [boom]

Pour le moment, mon pc a traité 9% de son package ! Et vous ?

J'ai déjà seti@home, est-cce qu'avec ma casserole, les deux pourront tourner en mêm temps? de façon utile, je veux dire.

oui :) mais je pense que tu devras peut etre modifier la priorité pour que seti de prenne pas le dessus ... si tu es en console, tu peux le faire quand tu la lance la premiere fois :)

Bonjour, J'ai installé Foldina@home sur mes 2 ordi mais je n'ai pas su voir de quand date ce projet? Jusqu'à quand est-il "ouvert"?

nicolas65> normalement tu devrais avoir un fichier unitinfo.txt dans ton répertoire d'installation de folding@home. Si tu l'ouvres, tu y trouveras qqchose comme ca: [code]Current Work Unit ----------------- Name: p931_fkbound_l14 Download time: March 17 07:44:44 Due time: April 2 07:44:44 Progress: 0% [__________][/code] Name est le nom du projet sur lequel tu travailles Download time est la date/heure a laquelle la "Work Unit" a été téléchargée Due time est la date/heure avant laquelle les résultats du calcul doivent etre renvoyé Progress est le pourcentage de progression dans les calculs. attention: les heures données sont alignées sur GMT. Donc pour moi, dans cet exemple, la WU a été téléchargée il y a qq minutes (France = GMT +1) et je dois finir et renvoyer les calculs avant le 2 Avril

Tu parles du projet de maniere plus global ? c'est a dire folding@home ? a se moment la je ne serait pas te le dire :p en fait,le projet a l'air d'avoir encore de beaux jours devant lui ... personnellement je suis actif depuis plus d'un an :) sinon, pour en savoir plus, tu peux aller la : http://www.alliancefrancophone.org/stanford/foldingathome/about.html :) sinon, bienvenue a tous les nouveaux :)

Modifié par Wis le 17/03/2004 21:32

Bonjour, Après l'installation de Folding@Home sur mon pc (PIV, 3Ghz)je constate, lorsque je ne me sers pas du pc, une utilisation du processeur à 50%. Avec comme conséquence qui m'inquiète, une température de 58 à 60°C alors que sans Folding@Home, la température normale ne dépasse jamais 50°C. Est-ce que cette température de 58 à 60°C peut-être, à la longue, nuisible pour ma carte-mère ???

ah oui... bonne question, Wis... je n'avais pas vu le msg de nicolas65 de cette facon [smile]

Et ceux qui ne connaissent pas un traitre mot d'anglais ( à part week end :o) alors ? Amicalement pepet

Pepet, qu'est ce qui n'est pas clair ou qui pose probleme ?

heu non, ca va encore perso, je conseil de pas l'installer si ca arrive a 65 degré ...

Bonsoir Wis, Effectivement je parlais du projet de manière globale. Bien vu. Merci pour les renseignements

[rougir] wis, où voit-on la température ???

Il faut telecharger un soft pour ca :) personnellement,j'utilise le soft "speedfan" .. http://telecharger.01net.com/windows/Utilitaire/optimiseurs_et_tests/fiches/25436.html hop :)

Bonjour à tous, j'aurais une(des) petite(s) question(s), quand je veux couper mon PC que dois-je faire avec le programme? lorsque j'allume mon pc dois-je faire quelques choses de particulier? est-ce que je le vois dans MSconfig? (pour ne pas le supprimé quand je fais du tri si son nom differe de ce que je connais ) et pour finir j'ai adware et sypbot vont-il l'identifié comme espion? Merci d'augmenter mes connaissances.

Merci Wis !

@Matata, de rien ;) rien a faire, si c'est en mode console, le mieux, c'est de faire un ctrl c ... mais ca marche bien sans :) si c'est en mode graphique, ca se fera automatiquement :) ca depend, tu as installé quelle version ? si tu as installé la version console, l'as tu mises en console ?:) je suppose que oui :) et si c'est dans la version graphique, ca doit contenir FAH dedans :) Non :) note que j'ai pas testé avec spybot, mais je suis quasi sur qu'il ne le detectera pas en temps que spyware ;) de rien, n'hesite pas a continuer à m'en poser :)

Modifié par Wis le 18/03/2004 17:29

L'arret du client console sous Win9x/Me (mais pas sous NT, 2000, XP, 2003) peut poser des "problemes": il est possible que Windows dise que le client tourne toujours et refuse de l'arreter sans une boite de confirmation... sinon, je confirme que spybot (avec les mises a jour d'il y a qq jours) ne trouve rien ... mais comme folding@home n'est pas un espion, ce n'est pas étonnant [smile]

Ben pour le peu que j'en ai vu , c'est tout en anglais . Si je fais quelque chose j'aime bien comprendre amicalement PePet

ben je te conseil : http://www.alliancefrancophone.org/ tu auras tout les renseignements en francais :) sinon le site http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/ est en cours de traduction (par nos soin ! ) et donc si tu clic sur le drapeau francais, tu auras une partie en francais :) voila :)

Bonsoir Et une adepte de plus [smile] Et la température de mon processeur ne bouge pas, toujours pareil. @ +

Bonjour, maintenant ce qui m'inquiète est que j'arrive à ça: Copyright (c) Jay William Ponder 1990-2000 portions Copyright (c) Michael Shirts 2001 portions Copyright (c) Vijay S Pande 2001 mais dans un fichier texte qui s'apelle "unitinfo le pourcentage que je vois est sur O% est-ce normale? merci

re :) 1/2H après cela: Copyright (c) Jay William Ponder 1990-2000 portions Copyright (c) Michael Shirts 2001 portions Copyright (c) Vijay S Pande 2001 il me marque: finished a frame(4) finished a frame(5) et la ça fait 1/2 que ça ne bouge pas dans le fichier ou la progression est visible. Est ce normale? désolé pour ces questions mais j'aimerais bien que ça fonctionne...