C'est un truc qui m'est arrivé plusieurs fois avec MPEGStreamclip (qui est génial la pupart du temps).
Tu peux dans un premier temps faire un essai avec VisualHub, je crois qu'il y a une période de démo, ou la démo sur le début des fichiers. C'est un logiciel qui mérite la dépense (dommage que l'€ baisse !).
http://www.macupdate.com/info.php/id/21888/visualhub
Sinon, la conversion dans QuickTime en achetant QuickTime Pro devrait marcher, mais tout encodage dans QT est épouvantablement long.
Le problème avec les fichiers avi, c'est que ce sont des conteneurs et qu'on ne sait jamais très bien ce qu'il y a dedans.
Une application qui peut rendre de grands services pour les infos d'un fichier audio et/ouvidéo : VideoSpec, francisé
http://www.macupdate.com/info.php/id/25921/videospec
ou son aînée en anglais : MediaInfo Mac
http://www.macupdate.com/info.php/id/26861/mediainfo-mac